Transportery ABC i NR4A1 identyfikują spoczynkowy podzbiór komórek T pamięci rezydujących w tkankach czesc 4

Ponieważ komórki Tsp były szczególnie wzbogacone w komórki Trm z komórek CD8 +, analizowaliśmy odsetek komórek zatrzymujących znacznik na końcu pięciotygodniowej sekwencji w przedziałach Tsp lub NSP komórek Trl PP lub IEL. Komórki SP CD8 + Trm z PP i IEL miały znacząco wyższy odsetek komórek zatrzymujących znacznik w porównaniu z komórkami NSP (Figura 3, F i G). W przeciwieństwie do mysich tkanek i ludzkiej krwi, nie byliśmy w stanie wykryć komórek Tsp w mysiej krwi (Suplementowa Figura 3C). Wszystkie te dane identyfikują odrębny przedział wolniejszego cyklu w komórkach Trm przewodu pokarmowego i wykazują, że fenotyp łodygi identyfikuje funkcjonalnie odrębną podgrupę ludzkich / mysich komórek T z fenotypem wolnoobrotowym w przedziale Trm. Odrębny profil ekspresji genów w ludzkich komórkach T CD8 +. W celu lepszego zrozumienia funkcjonalnych właściwości komórek Tsp, porównywano transkryptom oczyszczonych ludzkich komórek T CD8 + z komórkami T CD8 + nie będącymi na CD8 +, wyizolowanymi z tego samego dawcy. Analiza głównego składnika (PCA) wykazała, że komórki Tsp miały wyraźny profil ekspresji genu, który był bardziej zbliżony do profilu komórek TTT CD8 + niż Tcm lub naiwnych komórek T CD8 + (Figura 4A i Suplementowa Figura 4). Analiza dyskryminacyjna dla genów zróżnicowanych regulacyjnie w przedziale CD8 + na mysz w porównaniu z innymi podzbiorami komórek T CD8 + zidentyfikowała 119 transkrypty, które utworzyły rdzeń podpisu CD8 + na łykach (Figura 4B, dodatkowa Figura 4 i Tabela Uzupełniająca 1). Analiza szlaków MetaCore dla terminów G0 ujawniła, że szlaki związane z sygnaturą szczytową Tsp są regulacją metaboliczną i cyklem komórkowym (Figura 4C). Podobna analiza komórek CDP z CD4 + ujawniła, że geny nadeksprymowane w komórkach Tsp CD4 + były bardzo podobne do tych w komórkach T CD8 + (dane nie pokazane). Kilka genów poddanych nadmiernej ekspresji w komórkach Tsp jest związanych z komórkami Trm, a geny zawierające ostatnio opisaną sygnaturę rdzeniową ludzkich komórek Trm (27) skóry były zwiększone w komórkach T CD8 + w porównaniu z naiwnymi, CD8 + Tem i odpowiednikami Tcm (Figura 4D) . Ta rdzeniowa ludzka podpis na łysinie CD8 + zawierała XCL1, SKIL, SIK1 i kilku członków rodziny jądrowych hormonów czynników transkrypcyjnych NR4A1 (znanego również jako NUR77), NR4A2 i NR4A3, które również pokrywają się z genomową sygnaturą mysich komórek Tr CD8 + ( 10) (Figura 4D). Wspólne wzbogacanie transporterów NR4A i ABC w komórkach Tsp i Trm doprowadziło nas do przetestowania hipotezy, że te geny mogą odgrywać ważną rolę w biologii komórek Trm. Figura 4 Ludzkie komórki CD8 + z Tsp wykazują wyraźny profil ekspresji genu. (A) wykres PCA porównujący naiwne komórki CD8 +, CD8 + Tem, CD8 + Tcm i CD8 + Tsp. (B) Diagram Venna z różnie regulowanych transkryptów (> 4-krotnie) w CD8 + Tsp w porównaniu z limfocytami T naiwnymi, Tem i Tcm CD8 +. (C) 10 pierwszych haseł GO z analizy szlaku MetaCore genów wzbogaconych w komórki T CD8 +. (D) Względna ekspresja genów Trm ludzkiej skóry we krwi komórek T CD8 + w porównaniu z komórkami T CD8 + naiwne, Tem i Tcm. Wpływ NR4A1 na komórki Trp CD8 +. Rodzina czynników transkrypcyjnych z rodziny NR4A jest zaangażowana w regulację rozwoju limfocytów T, a także w uspokojenie HSC, w tym podzbioru HSC z fenotypem SP (22, 23, 28, 29). Ponieważ wydaje się, że te geny są specyficznie nadeksprymowane w komórkach Tsp i Trm, przeanalizowaliśmy rolę NR4A1 w generowaniu komórek Trm przy użyciu adoptywnego transferu komórek T z niedoborem NR4A1 (określanych tu jako Nur77 (3 (y)) w zakażeniu grypowym. Model. Chimery komórek T CD8 + wytworzono przez przeniesienie nieskutecznych wobec V22 komórek CD8 + z CD45.1 WT-OT-1 i CD45.2 Nur77a / | Komórki OT-1 w stosunku 1: 1, a te myszy zakażono wirusem grypy wykazującym ekspresję OVA. Zarówno WT, jak i Nur77. /. Komórki T CD8 + OT-1 ekspandowano porównywalnie we wczesnej (dni 8-14) fazie efektorowej (Suplementowa Figura 5, A i B), ale proporcja Nur77a /. Limfocyty T CD8 + zmniejszono do 35 dnia po zakażeniu. Różnice między Nur77. /. a chimeryzm WT był najgłębszy w przedziale Trm w wątrobie, PP i IEL, z minimalnym wpływem na komórki inne niż Trm za wyjątkiem PP (Figura 5, A i B). Łącznie dane te sugerują, że NR4A1 odgrywa ważną rolę w regulowaniu miejsca zamieszkania tkanki mysich komórek Trl CD8 +. Figura 5 Wpływ Nur77 na komórki Tr8 CD8 +. Cytometria przepływowa na komórkach T V8 CD8 + otrzymanych z chimer wytworzonych przez rekonstytucję myszy WT z mieszaniną 1: WT OT-1 i Nur77a / r. Komórki OT-1, a następnie oceniane w dniu 35 po zakażeniu wirusem grypy X-31 OVA. (A) Analiza FACS pokazująca komórki CD45.2 (Nur77a / OC-1) i CD45.1 (WT OT-1) w śledzionie, BM, wątrobie, płucu, PP i IEL. (B) Wykresy słupkowe przedstawiają bezwzględną liczbę Nur77. /. Komórki T CD8 + OT-1 i WT OT-1 z różnych narządów
[hasła pokrewne: alzheimer pierwsze objawy, nfz warszawa leczenie uzdrowiskowe, żel do mycia twarzy bioliq ]
[hasła pokrewne: sinulan ulotka, jak oduczyć psa skakania, flucontrol max ]